Gelardan, un grand et diabolique collectioneur de Pokémon, va réussir à capturer Elekthor et Sulfura… Sans vraiment le savoir, l’équilibre du monde va être totalement chamboulé. Pendant ce temps, Sacha et ses amis arrivent par mégarde sur une île, pour la cérémonie des oiseaux légendaires.
C’est là que Sacha sera nommé « l’élu » qui devra rétablir l’équilibre,